完善廢棄物安全管理制度
實驗室化學廢棄物，具有成分復雜多變，無固定排污量及集中排污點，難以進行大規模集中處理等特點，處理難度很大，容不得半點馬虎與造假，必須要有強制性的處置規定，包括法律法規、標準及技術手冊等規定，切實加強對實驗室藥品和樣品的安全監管，指導各實驗室根據化學性質建立處理方法，實現實驗室廢棄物的無害化處理，打造綠色化學實驗室，保護生態環境。
廢棄物的清單管理
每個實驗室都應設置嚴密的廢棄物清單，固體的、液體的與氣體的，包括未能用盡的試劑及其包裝、實驗過程的副產品與泄漏物、實驗結束后的清理物，根據化學藥品和樣品廢棄物的理化特性，進行分類例如毒性、放射性、腐蝕性、酸堿性、易燃性、爆炸性、氧化性、還原性、污染性。
對每一類廢棄物應標明來源、主要組成、化合物性質，提示可能產生的有毒氣體、發熱、噴濺及爆炸等危險。為防止二次污染，以盡量選用無害或易于處理的藥品或方法為原則，標明具體處理措施，如用漂白粉處理含氰廢水，用生石灰處理某些酸液，用廢酸液“以廢治廢”處理廢堿液。無法妥善處理，必須標明合法的專業處理機構名稱。
處理實驗室廢棄物時，應建立嚴格的處置臺賬，對處理人、處理數量、處理方式、處理時間等相關信息進行詳細記錄，雙人審核，定期檢查，長期存檔。
廢棄物的分類收集
實驗室廢棄物應依不同性質進行分類收集，不具相容性的實驗廢棄物應分別收集儲存，應由檢測人員按分類規定進行分類收集，分別倒于實驗室指定的儲存容器內收集。對易燃、易爆、劇毒等化學物品在使用中及使用后的廢渣、廢液，實驗操作人員應及時妥善處理、分類倒入指定的容器內，嚴禁亂放亂丟。對實驗使用后的培養基、標本和菌種保存液，一次性的醫療用品及一次性的器械，都應嚴格按規定進行有效消毒并放置指定的容器內。
特殊廢棄物的特殊處理
處置不當有可能造成嚴重后果，或者本室沒有處理資質或能力的，列為特殊廢棄物，必須采取特殊處理措施。
1. 對爆炸性實驗室廢棄物，例如金屬鈉、苦味酸、金屬疊氮化物、有機疊氮化物、有機過氧化物等，應交由消防隊或公安局處置。
2. 劇毒廢棄物，例如砒霜，應交由公安機關批準的專業公司回收并處理。
3. 傳染性廢棄物，必須參照《醫療廢物集中處置技術規范》進行處理，或者在醫療機構指導下處理。
4. 放射性廢棄物，應區分放射水平、廢棄物種類、同位素的放射性質，對低濃度的用水或惰性材料稀釋到允許濃度后排放，對高濃度的經沉淀過濾收集后處理。
5. 對未知來源和性質的廢棄物，有水溶性的，也有難溶性的，應綜合判定其物理化學特性與毒性，進行分類、選擇處理方法并進行處理。
6. 對原物質殘余量小于3%的空容器，可當作惰性垃圾處理，建議所有容器在處理前應選擇合適的清洗液進行清洗，如果殘留物含有《國家危險廢物名錄》中的廢物，處理時應遵照《廢棄危險化學品污染環境防治辦法》。
7. 對石棉類廢棄物，應淋濕后裝入防漏的密封容器，交由官方指定場所處理，為防止搬運過程中的散落，容器上應作醒目標示“小心，含有石棉，嚴禁開啟或損壞容器，吸入石棉有害健康”。
8. 對被污染的器皿，如果不能清潔、回收，則按廢棄物處理，對列于危險的則按照危險實驗室廢棄物處理。
廢棄物的貯存場所
為確保廢棄物能夠抵御自然外力及人為因素的破壞，應高度重視貯存場所建設，貯存設施、設計、運行、安全防護和監測等均應符合標準，并在明顯處設置警示牌，應有專人負責，定期檢查并記錄。一要遠離熱源，對高溫易爆或易腐敗的特殊廢棄物還應在低溫下貯存。二要分類貯存，不相容的廢棄物不得混合貯存，且廢棄物容器上應加貼標簽，對混合后有可能產生危險后果的不同類別，對不同來源的廢棄物，切勿貪省事而裝載在同一容器內。三要防止膨脹，確保容器內的液體廢棄物在正常的處理、存放及運輸時，不因溫度或其他物理狀況轉變而膨脹，造成容器泄漏或永久變形。四是要通風良好，不得有散遺、滲出、污染地面或散發惡臭等情形。
做好人員的安全防護。制訂嚴格的操作規范，要求實驗室人員必須按規范處理廢棄物，如配備專用的防濺眼罩、手套和工作服，在特殊情況下于通風柜外處理廢棄物時，操作人員必須帶上具有過濾功能的防毒面具。制訂嚴格的應急程序，在醒目處張貼，定期組織應急演練，備置足夠、合格的應急器材，以應對在處理、收集及存放實驗室廢棄物時發生的溢出、泄露、火災等緊急情況。
